| 
                         无论是实际网络还是对模型网络进行分析,都离不开对网络拓扑统计指标的计算。反映网络结构与动力学特性的统计指标有很多,Costa等的一文对此有全面的综述,本文仅介绍一些常用的统计指标在NetworkX中如何计算。
  一、度、度分布
  
NetworkX可以用来统计图中每个节点的度,并生成度分布序列。下边是一段示例代码(这段代码可以在Shell里一行一行的输入,也可以将其保存为一个以py结尾的纯文本文件后直接运行),注意看注释部分:
  
import networkx as nx 
G = nx.random_graphs.barabasi_albert_graph(1000,3) #生成一个n=1000,m=3的BA无标度网络 
print G.degree(0) #返回某个节点的度 
print G.degree() #返回所有节点的度 
print nx.degree_histogram(G) #返回图中所有节点的度分布序列(从1至最大度的出现频次)
  
对上述结果稍作处理,就可以在Origin等软件里绘制度分布曲线了,当然也可以用matplotlib直接作图,在上述代码后接着输入:
  
import matplotlib.pyplot as plt #导入科学绘图的matplotlib包 
degree = nx.degree_histogram(G) #返回图中所有节点的度分布序列 
x = range(len(degree)) #生成x轴序列,从1到最大度 
y = [z / float(sum(degree)) for z in degree] 
#将频次转换为频率,这用到Python的一个小技巧:列表内涵,Python的确很方便:) 
plt.loglog(x,y,color="blue",linewidth=2) #在双对数坐标轴上绘制度分布曲线 
plt.show() #显示图表
  二、群聚系数
  
这个在NetworkX里实现起来很简单,只需要调用方法nx.average_clustering(G) 就可以完成平均群聚系数的计算,而调用nx.clustering(G) 则可以计算各个节点的群聚系数。
  三、直径和平均距离
  
nx.diameter(G)返回图G的直径(最长最短路径的长度),而nx.average_shortest_path_length(G)则返回图G所有节点间平均最短路径长度。
  四、匹配性
  
这个也比较简单,调用 nx.degree_assortativity(G) 方法可以计算一个图的度匹配性。
  五、中心性
  
这个我大部分不知道怎么翻译,直接上NX的帮助文档吧,需要计算哪方面的centrality自己从里边找:)
  
Degree centrality measures.(点度中心性?) 
degree_centrality(G)  Compute the degree centrality for nodes. 
in_degree_centrality(G)  Compute the in-degree centrality for nodes. 
out_degree_centrality(G)  Compute the out-degree centrality for nodes.
  
Closeness centrality measures.(紧密中心性?) 
closeness_centrality(G[,v,weighted_edges])  Compute closeness centrality for nodes.
  
Betweenness centrality measures.(介数中心性?) 
betweenness_centrality(G[,normalized,...])  Compute betweenness centrality for nodes. 
edge_betweenness_centrality(G[,...])  Compute betweenness centrality for edges.
  
Current-flow closeness centrality measures.(流紧密中心性?) 
current_flow_closeness_centrality(G[,...])  Compute current-flow closeness centrality for nodes. 
Current-Flow Betweenness
  
Current-flow betweenness centrality measures.(流介数中心性?) 
current_flow_betweenness_centrality(G[,...])  Compute current-flow betweenness centrality for nodes. 
edge_current_flow_betweenness_centrality(G)  Compute current-flow betweenness centrality for edges.
  
Eigenvector centrality.(特征向量中心性?) 
eigenvector_centrality(G[,max_iter,tol,...])  Compute the eigenvector centrality for the graph G. 
eigenvector_centrality_numpy(G)  Compute the eigenvector centrality for the graph G.
  
Load centrality.(彻底晕菜~~~) 
load_centrality(G[,cutoff,...])  Compute load centrality for nodes. 
edge_load(G[,nodes,cutoff])  Compute edge load.
 
  六、小结
  
上边介绍的统计指标只是NetworkX能计算的指标中的一小部分内容,除此之外NetworkX还提供了很多(我还没有用到过的)统计指标计算方法,感兴趣的朋友可以去查NetworkX的在线帮助文档:。对于加权图的统计指标计算,NetworkX似乎没有直接提供方法(也可能是我没找到),估计需要自己动手编制一些程序来完成。 
转自:                         (编辑:莱芜站长网) 
【声明】本站内容均来自网络,其相关言论仅代表作者个人观点,不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利,请及时与联系站长删除相关内容! 
                     |